Στο ΣτΕ προσέφυγαν ο Δήμος Μεσολογγίου και ο Δικηγορικός Σύλλογος Μεσολογγίου.
Στο Συμβούλιο της Επικρατείας προσέφυγαν ο Δήμος Μεσολογγίου, ο Δικηγορικός Σύλλογος Μεσολογγίου, καθώς και ιδιώτες (καθηγητές και φοιτητές), ζητώντας να ακυρωθεί ως παράνομο και αντισυνταγματικό το Προεδρικό Διάταγμα 94/2013, βάσει του οποίου προβλέπεται η συγχώνευση των ΤΕΙ Πατρών και Μεσολογγίου, σε ΤΕΙ Δυτικής Ελλάδας.
Πρόκειται για ένα από τα Προεδρικά Διατάγματα του σχεδίου «Αθηνά» του υπουργείου Παιδείας, για την αναδιοργάνωση της τριτοβάθμιας εκπαίδευσης. Οι προσφεύγοντες ισχυρίζονται, ότι κατά την κατάρτιση του σχεδίου συγχώνευσης δεν ελήφθησαν υπόψη τα προβλεπόμενα στο νόμο ορθολογικά και χωροταξικά κριτήρια, καθώς επίσης και ότι στο διάταγμα, δε γίνεται αναφορά στο ακριβές κόστος της συγχώνευσης, όπως ορίζει ο νόμος. Τέλος, οι προσφεύγοντες επικαλούνται παραβίαση του αρ.16 του Συντάγματος και της αρχής του αυτοδιοίκητου των πανεπιστημίων, καθώς δεν προβλέπεται αντιπροσωπευτική διοικούσα επιτροπή, κατά την μεταβατική περίοδο λειτουργίας του ΤΕΙ Δυτικής Ελλάδας.